شناسایی آنالوگ‌های ژنهای مقاومت به بیماری (RGAs) در جمعیت F1 درحال تفرق سیب‌زمینی با استفاده از تکنیک NBS profiling
نویسندگان
چکیده مقاله:
به‌منظور شناسایی و جداسازی آنالوگ‌های ژنهای مقاومت (RGAs) در سیب‌زمینی، 46 ژنوتیپ از جمعیت F1 درحال تفرق دیپلوئید RH×SH با حداکثر نوترکیبی با استفاده از تکنیک NBS Profiling در آزمایشگاه ژنومیکس دانشگاه واگنینگن هلند مورد ارزیابی قرار گرفتند. با استفاده از پنج آغازگر دژنره طراحی‌شده براساس موتیف‌های حفاظت‌شده دامنه NBS، در مجموع 187 نشانگر چندشکل تولید شد که در ارتباط با نقشه AFLP جمعیت متشکل از 10000 نشانگر مکان‌یابی شدند. پس از توالی‌یابی تعدادی از نشانگرها و همردیف کردن آنها، 68 نشانگر با ژنهای مقاومت شناخته‌شده یا پروتئین‌های مقاومت به بیماری گروه TIR-NBS-LRR همولوژی نشان دادند. هفت تا از این RGAها جایگاه ژنی و توالی مشابه با ژنهای مقاومت شناسایی‌شده در سیب‌زمینی یا گوجه-فرنگی داشتند. سی‌و‌هفت RGA توالی‌یابی‌شده در نواحی کروموزومی مشابه با ژنهای مقاومت شناسایی‌شده یا RGAها در گوجه-فرنگی یا سیب‌زمینی مکان‌یابی شدند بدون اینکه با این ژنهای مقاومت یا RGAها از نظر توالی دارای همولوژی باشند و بقیه RGAها نیز در جایگاه‌هایی مکان‌یابی شدند که تاکنون در آنها RGA گزارش نشده است. اکثر این RGA ها در خوشه‌ها یا زیرخوشه-های جدید یا موجود در نقشه قرار گرفتند. در بررسی رابطه فیلوژنی، توالی‌های RGA براساس آغازگر دژنره مورداستفاده برای تکثیر تفکیک شدند. نتایج حاصل از این پژوهش می‌تواند در مکان‌یابی ژنهای مقاومت منفرد و مکان‌های کمی مقاومت به بیماری‌ها مورداستفاده قرار گیرد.
منابع مشابه
شناسایی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری (rgas) در جمعیت f۱ درحال تفرق سیب زمینی با استفاده از تکنیک nbs profiling
به منظور شناسایی و جداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت (rgas) در سیب زمینی، 46 ژنوتیپ از جمعیت f1 درحال تفرق دیپلوئید rh×sh با حداکثر نوترکیبی با استفاده از تکنیک nbs profiling در آزمایشگاه ژنومیکس دانشگاه واگنینگن هلند مورد ارزیابی قرار گرفتند. با استفاده از پنج آغازگر دژنره طراحی شده براساس موتیف های حفاظت شده دامنه nbs، در مجموع 187 نشانگر چندشکل تولید شد که در ارتباط با نقشه aflp جمعیت متشکل ا...
متن کاملجداسازی ژنهای مقاومت به بیماری زنگ برگی جو و تولید نشانگرهای مبتنی بر pcr با استفاده از روش nbs profiling
زنگ برگی جو با عاملpuccinia hordei otth. یکی از مهم ترین بیماری های جو می باشد که سالانه باعث کاهش عملکرد قابل ملاحظه ای در محصول جو می شود. استفاده از ژنوتیپ های مقاوم یکی از موثرترین و اقتصادی ترین روش ها برای کنترل بیماری می باشد. تاکنون روش های متفاوتی از قبیل غربالگری در مزرعه و گلخانه، انتخاب به کمک نشانگرها و روش های مولکولی دیگری مانند آنالیز rgaها، جهت شناسایی منابع جدید مقاومت به زنگ ...
15 صفحه اولجداسازی آنالوگ‌های ژنهای مقاومت به بیماری(RGAs) در سیب‌زمینی با استفاده از روش
استفاده از ارقام مقاوم یکی از راه‌کارهای اصلی کاهش خسارت ناشی از تنش‌های زیستی در گیاهان است. لازمه تولید چنین ارقامی شناسایی، جداسازی و مکان‌یابی ژنهای مقاومت به بیماری است. در این پژوهش، برای جداسازی آنالوگ‌های ژنهای مقاومت به بیماری در سیب‌زمینی از روش Motif directed Profiling (MdP) استفاده شد. بدین منظور، هفت آغازگر دژنره طراحی شده براساس دامنه حفاظت‌شده TIR ژنهای مقاومت به بیماری گیاهی...
متن کاملجداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری(rgas) در سیب زمینی با استفاده از روش
استفاده از ارقام مقاوم یکی از راه کارهای اصلی کاهش خسارت ناشی از تنش های زیستی در گیاهان است. لازمه تولید چنین ارقامی شناسایی، جداسازی و مکان یابی ژن های مقاومت به بیماری است. در این پژوهش، برای جداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری در سیب زمینی از روش motif directed profiling (mdp) استفاده شد. بدین منظور، هفت آغازگر دژنره طراحی شده براساس دامنه حفاظت شده tir ژن های مقاومت به بیماری گیاهی ...
متن کاملآنالیز پروفایل nbs (nucleotide binding-site) ژنهای مقاومت به بیماری در ارقام مختلف زیتون
به منظور مطالعه ژنهای مقاومت nbs-lrr و تنوع ژنتیکی آنها در بین ارقام بومی زیتون و همچنین مقایسه آن با ارقام خارجی، از تکنیک profiling nbs و آنالیزهای مولکولی استفاده شد. برای این منظور dna ژنومی تعداد 5 رقم خارجی و 5 رقم داخلی زیتون استخراج و با آنزیم های برشی alui و rsai هضم و با استفاده از 3 آغازگر دژنره( nbs2،nbs7،nbs5a) در دو مرحله تکثیر شدند و الگوی باندی حاصل از تکثیر انتخابی آنها در روی ...
اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 12 شماره 2
صفحات 185- 198
تاریخ انتشار 2010-07
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023